Pjevač grupe “Queen” u karijeri je postigao sve što je želio, ali iako je na pozornici djelovao nezaustavljivo, Fredi je privatno bio sasvim drugačiji: povučen, nepovjerljiv, introvertan i sklon naglim promjenama raspoloženja. Jedina osoba kojoj je bezrezervno vjerovao bila je Meri Ostin, djevojka iz siromašne porodice čiji su roditelji bili gluvonijemi. Upoznao ju je 1970. u londonskom butiku “Biba”, gdje je radila, i odmah ga je privukla, a i on nju.
“Takvog momka nikada prije nisam srela. Izgledao je kao vitez dok je sjedio u fotelji, a ruka mu počivala na naslonu. Brzo smo se sprijateljili, ali trebale su mi tri godine da se zaljubim u njega. Kad se to dogodilo, shvatila sam da nikad ni prema kome nisam osjećala ono što sam osjećala prema njemu. Bio je magnetski privlačan. Na početku veze živjeli smo u malom stanu u Kensingtonu i imali tako malo novca da smo zavjese mogli da priuštimo samo na prozorima u spavaćoj sobi. Kupatilo i kuhinju dijelili smo s još jednim parom, ali ništa nije moglo stati na put našoj ljubavi”, ispričala je kasnije Meri Ostin, koja je s Merkjurijem ostala punih šest godina.
Tokom tog vremena grupa “Queen” je postala slavna širom svijeta. Meri se potajno bojala da će joj neka druga žena preoteti Fredija, ni ne sluteći da njega razdiru neka sasvim drugačija osjećanja. Naime, on se tada borio sam sa sobom otkrivši da je homoseksualac. Odnosi su im zahladnjeli, on je svake večeri dolazio kući vrlo kasno i među njima više nije bilo nekadašnje bliskosti. Jednog dana Meri mu je u očaju rekla:
“Nešto se događa, osjećam da te nešto steže poput omče oko vrata. Mislim da je trenutak da odem”.
Ali Merkjuri tada još nije bio spreman za otvoreni razgovor. Tvrdio je da je sve u redu iako je ona osjećala da nešto krije od nje. Na kraju, kad je i sam postao svjestan da više ne može da se bori s vlastitim demonima, priznao joj je istinu – da se zaljubio u jednog muzičkog producenta. Premda je ta veza bila kratkog vijeka, rezultirala je raskidom s Meri. Nakon prvobitnog šoka ona se pribrala i pokazala veliko razumijevanje za njegova osjećanja. Iselila se iz kuće, a Fredi joj je zauzvrat kupio stan u neposrednoj blizini i zaposlio je kao svoju sekretaricu.
“Svi moji ljubavnici su me pitali zašto ne mogu da zamijenim Meri, ali to je jednostavno nemoguće. Ona je bila moja nevjenčana supruga. Osim toga, moram priznati da se, iako sam shvatio da sam homoseksualac, nikada više nisam zaljubio tako snažno kao u nju. Možda je razlog u tome što nisam stvoren za porodicu. Previše sam nemiran u duši, previše nervozan… Meri je to razumjela i davala mi slobodu koja mi je bila potrebna. Poslije našeg rastanka uvijek bi mi bilo drago kad bi bila srećna s nekim. I ona je osjećala isto za mene. Brinuli smo jedno za drugo, a to je predivan oblik ljubavi. Ali nakon nje sam, na neki način, zamrzio ljubav. Kad je čovjek zaljubljen, nema kontrolu nad emocijama, a to mi se ne sviđa. Možda nekima izgledam kao gruba muškarčina, ali zbog ljubavi sam isplakao rijeke suza. I s Meri sam prekinuo uz mnogo suza, ali naša veza je bila toliko jaka da nam je niko ne može uzeti. Ona je i danas moj najbolji prijatelj”, priznao je poslije Merkjuri.
Nakon što se rastao s Meri 1980. pjevač se odao neobuzdanom životu i počeo da mijenja ljubavnike kao čarape. Uopšte mu nije bilo važno iz kojeg društvenog sloja dolaze, pa je tako među njima bilo konobara, stjuarda, bolničara, njegovih radnika…
Rijetko je ulazio u veze s javnosti poznatim muškarcima, a glasine da je imao afere s baletanom Rudolfom Nurejevim i glumcem Rokom Hadsonom, koji je takođe umro od posljedica side, nikada nije potvrdio. Ipak, zna se da se viđao s glumcem i pjevačem Piterom Strakerom, nakratko i s jednom ženom, njemačkom glumicom Barbarom Valentin, kao i nekadašnjim misterom Velike Britanije, Piterom Morganom. Ovog drugog ostavio je poslije šest mjeseci, čim je otkrio da ga mišićavi ljepotan vara. Iako je i sam “šarao”, svojim ljubavnicima to nije opraštao.
